hsp65 PCR-restriction enzyme analysis (PRA) for identification of mycobacteria in the clinical laboratory

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dc.contributor.authorSilva, Carolina Feher da [UNIFESP]
dc.contributor.authorUeki, Suely Yoko Mizuka
dc.contributor.authorGeiger, Débora de Cássia Pires [UNIFESP]
dc.contributor.authorLeao, Sylvia Cardoso [UNIFESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.contributor.institutionInstituto Adolfo Lutz de São Paulo Setor de Micobactérias
dc.date.accessioned2015-06-14T13:29:17Z
dc.date.available2015-06-14T13:29:17Z
dc.date.issued2001-02-01
dc.description.abstractMore than 70 species of mycobacteria have been defined, and some can cause disease in humans, especially in immunocompromised patients. Species identification in most clinical laboratories is based on phenotypic characteristics and biochemical tests and final results are obtained only after two to four weeks. Quick identification methods, by reducing time for diagnosis, could expedite institution of specific treatment, increasing chances of success. PCR restriction-enzyme analysis (PRA) of the hsp65 gene was used as a rapid method for identification of 103 clinical isolates. Band patterns were interpreted by comparison with published tables and patterns available at an Internet site (http://www.hospvd.ch:8005). Concordant results of PRA and biochemical identification were obtained in 76 out of 83 isolates (91.5%). Results from 20 isolates could not be compared due to inconclusive PRA or biochemical identification. The results of this work showed that PRA could improve identification of mycobacteria in a routine setting because it is accurate, fast, and cheaper than conventional phenotypic identification.en
dc.description.abstractMais de 70 espécies de micobactérias já foram definidas e algumas delas podem causar enfermidade em humanos, especialmente em pacientes imunocomprometidos. A identificação de espécie, na maioria dos laboratórios clínicos, se baseia em características fenotípicas e testes bioquímicos e resultados definitivos só são obtidos após duas a quatro semanas. Métodos rápidos de identificação reduzem o tempo necessário para o diagnóstico e podem antecipar a instituição do tratamento específico, aumentando as chances de sucesso. A análise de padrões de restrição do gene hsp65 amplificado por PCR (PRA) foi utilizada como método rápido de identificação em 103 isolamentos clínicos. Os padrões de bandas foram interpretados por comparação com tabelas publicadas e padrões disponíveis em um site de Internet (<a HREF=http://www.hospvd.ch:8005/>http://www.hospvd.ch:8005</a>). Resultados concordantes de PRA e identificação bioquímica foram obtidos em 76 de 83 isolamentos (91,5%). Os resultados de 20 isolamentos não puderam ser comparados porque a identificação fenotípica ou por PRA foi inconclusiva. Os resultados deste trabalho mostram que PRA pode ser útil para identificação de rotina de micobactérias por ser um método acurado, rápido e mais econômico do que a identificação convencional.pt
dc.description.affiliationUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Escola Paulista de Medicina Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia
dc.description.affiliationInstituto Adolfo Lutz de São Paulo Setor de Micobactérias
dc.description.affiliationUnifespUNIFESP, EPM, Depto. de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia
dc.description.sourceSciELO
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
dc.format.extent25-28
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/S0036-46652001000100005
dc.identifier.citationRevista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical, v. 43, n. 1, p. 25-28, 2001.
dc.identifier.doi10.1590/S0036-46652001000100005
dc.identifier.fileS0036-46652001000100005.pdf
dc.identifier.issn0036-4665
dc.identifier.scieloS0036-46652001000100005
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/1108
dc.language.isoeng
dc.publisherInstituto de Medicina Tropical
dc.relation.ispartofRevista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectMycobacteriumen
dc.subjectPCRen
dc.subjectDiagnosisen
dc.subjectIdentificationen
dc.titlehsp65 PCR-restriction enzyme analysis (PRA) for identification of mycobacteria in the clinical laboratoryen
dc.title.alternativePCR e análise de padrões de restrição do gene hsp65 (PRA) para identificação de micobactérias no laboratório clínicopt
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
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