Desenvolvimento de um ambiente virtual de bioinformática capaz de analisar sequências do vírus da hepatite C, identificar genótipo, subtipo e mutações associadas à resistência de inibidores de protease.

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dc.contributor.advisorMello, Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho [UNIFESP]
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/7267507565320007
dc.contributor.authorPereira, Anderson Alvarenga [UNIFESP]
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/2529547420081379
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.date.accessioned2015-12-06T23:46:28Z
dc.date.available2015-12-06T23:46:28Z
dc.date.issued2013
dc.description.abstractO uso de antivirais de acao direta para o virus da Hepatite C tem mostrado que os Inibidores de Protease sao uma estrategia eficaz para o tratamento de pacientes portadores de virus do genotipo 1. Uma ferramenta de bioInformática capaz de identificar o genotipo, subtipo e mutacoes associadas a resistencia a esta classe de antivirais e de extrema importancia para a melhor administracao destes antivirais e monitoramento dos pacientes que possuem indicacao deste tipo tratamento. Este trabalho tem como objetivo o desenvolvimento de um ambiente virtual de bioInformática, propondo inferir, em larga escala, o genotipo e subtipo viral e se este virus e portador de mutacoes associadas a resistencia de Inibidores de Protease. A identificacao dos genotipos e subtipos e feita atraves de similaridade com um banco de referencia, utilizando a ferramenta BLAST. A busca da presenca de mutacoes associadas com resistencia no genoma viral e feita atraves do alinhamento entre a sequencia a ser analisada com a sequencia de referencia H77 do Virus da Hepatite C. Apresenta-se, ainda um pipeline de submissao de dados com interface amigavel onde e possivel submeter dados binarios (cromatogramas) e textos (fasta). O resultado final e um laudo de resistencia genotipica para os Inibidores de Protease contendo o genotipo e subtipo viral e a presenca ou ausencia de mutacoes associadas com a resistencia aos inibidores de protease e com seus niveis de resistencia determinadospt_BR
dc.description.sourceBV UNIFESP: Teses e dissertações
dc.format.extent57 f.
dc.identifier.citationPEREIRA, Anderson Alvarenga. Desenvolvimento de um ambiente virtual de bioinformática capaz de analisar sequências do Vírus da Hepatite C, identificar genótipo, subtipo e mutações associadas à resistência de Inibidores de Protease. 2013. 57f. Tese (Doutorado em Gastroenterologia) – Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo. São Paulo, 2013.
dc.identifier.fileanderson alvarenga- final - PDF A.pdf
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/23006
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.subjectHepaciviruspt_BR
dc.subjectHepacivirus/genéticapt_BR
dc.subjectInibidores de Proteasespt_BR
dc.subjectMutaçãopt_BR
dc.subjectBiologia Computacionalpt_BR
dc.subjectGenótipopt_BR
dc.titleDesenvolvimento de um ambiente virtual de bioinformática capaz de analisar sequências do vírus da hepatite C, identificar genótipo, subtipo e mutações associadas à resistência de inibidores de protease.pt_BR
dc.title.alternativeDevelopment of a bioinformatics virtual environment able to analyze sequences of the Hepatitis C Virus, identifying genotype, subtype and mutations associated with resistence to Protease Inibitorsen
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis
unifesp.campusSão Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM)pt_BR
unifesp.graduateProgramGastroenterologia
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