Caracterização molecular de um Deltabaculovirus (Baculoviridae) identificado em Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae)

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dc.contributor.advisorJanini, Luiz Mario Ramos [UNIFESP]
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/5713863164263481
dc.contributor.authorGil, Helio Benites [UNIFESP]
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/3377634721920974
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.coverage.spatialSão Paulo
dc.date.accessioned2018-07-27T15:49:59Z
dc.date.available2018-07-27T15:49:59Z
dc.date.issued2015-10-21
dc.description.abstractIntrodução: Os baculovírus são vírus que infectam insetos, causando a poliedrose nuclear. Atualmente são classificados em quatro gêneros: Alfabaculovirus, Betabaculovirus, Gammabaculovirus e Deltabaculovirus. Os mosquitos do gênero Culex são considerados ameaças à saúde pública, pois são vetores de agentes patogênicos ao homem, como o nematoide Wuchereria bancrofti e o vírus do oeste do Nilo, causadores da filariose linfática e da febre do oeste do Nilo, respectivamente. A utilização de baculovirus em programas de controle biológico provou sua eficiência para esse fim, tornando-os uma alternativa promissora ao uso de inseticidas químicos, uma vez que tem alta especificidade e não apresentam riscos conhecidos ao ambiente. Objetivo: Realizar a caracterização molecular de baculovirus encontrados em larvas de Culex quinquefasciatus. Métodos: Larvas foram obtidas através de coletas realizadas em córrego localizado em área urbana, na cidade de Caraguatatuba ? SP, e aquelas apresentando sinais de infecção por baculovirus foram selecionadas durante triagem e preparadas para os procedimentos de biologia molecular. Após extração de DNA, foi realizada a PCR e o sequenciamento com primers específicos para os genes analisados. Foram criados datasets com as sequências obtidas juntamente com sequências referência retiradas do banco de dados GeneBank para cada gene a ser analisado e um dataset para as sequências dos genes concatenadas. Seis topologias foram reconstruídas através da metodologia de máxima verossimilhança. Resultados: Em todas as árvores geradas as amostras analisadas no presente estudo se relacionaram com CuniNPV, única espécie descrita no gênero Deltabaculovirus, porém tal resultado não foi suficiente para resolver sua classificação de espécie. O principal fator limitante para a caracterização das amostras analisadas foi a carência de sequências disponíveis referentes ao gênero Deltabaculovirus. Contudo foi possível observar padrões indicativos de que os genes escolhidos são capazes de gerar topologias informativas a respeito da filogenia do grupo dos baculovirus, inclusive resolvendo clados de forma semelhante a análises feitas a partir de um número maior de genes. Conclusão: Esse estudo demonstrou que os baculovirus encontrados em larvas de Culex quinquefasciatus se classificaram no gênero Deltabaculovirus, e o conjunto de regiões genômicas utilizado definiu os baculovirus analisados em quatro grupos monofiléticos, corroborando com a literatura. pt_BR
dc.description.abstractIntroduction: Mosquitoes from Culex genus plays an important role on several vector-borne diseases, such filariasis and west-Nilo fever. Baculoviruses infect these insects, causing nuclear polyhedrosis, and this virus group is classified in four different genera: Alfabaculovirus, Betabaculovirus, Gammabaculovirus and Deltabaculovirus. The use of this viruses as biological control agents of insect is a promising alternative to chemical insecticides. Results from biological control programs showed high specificity and no known risk to environment. Objective: Molecular characterization of baculovirus from Culex quinquefasciatus larvae. Methods: Larvae samples were collected from urban stream in Caraguatatuba city, SP. DNA extraction were performed from larvae showing baculoviruses-infection symptoms. PCR and sequencing from Helicase, Polimerase, vlf-1, odv-e27 and lef-8 genes were performed. The contigs were aligned with reference sequences, for each gene and for all concatenated, from GenBank. Maximum likelihood topology search were performed for each dataset, resulting in 6 phylogenetic tree. Thousand bootstrap replicates were applied to topology evaluation. Results: Topology results suggests larvae sampes were related to CuniNPV. Nonetheless, we could not state the baculovirus species because this was the unique species described in Deltabaculovirus genus. This is explained by the GenBank Deltabaculovirus genus reference sequence bias. Howbeit, these genes showed fairly phylogenetic information, resolving clades similar to other informative regions. Conclusion: Our results showed that Culex quinquefasciatus larvae samples were from Deltabaculovirus genus. Moreover, the four genus clusters were observed, suggesting that genes can be used as phylogenetic markers.en
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
dc.description.sponsorshipIDFAPESP: 2012/23947-0
dc.format.extent61 f.
dc.identifierhttps://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=2962420
dc.identifier.citationGIL, Helio Benites. Caracterização molecular de um Deltabaculovirus (Baculoviridae) identificado em Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae). 2015. 61 f. Dissertação (Mestrado em Infectologia ) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2015.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/46305
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBaculovirusesen
dc.subjectCulex quinquefasciatusen
dc.subjectDeltabaculovirusen
dc.subjectMolecular biologyen
dc.subjectPphylogenetic analysisen
dc.subjectBaculoviruspt_BR
dc.subjectBiologia molecularpt_BR
dc.subjectAnálises filogenéticaspt_BR
dc.subjectVírus dos insetospt_BR
dc.subjectClassificação
dc.titleCaracterização molecular de um Deltabaculovirus (Baculoviridae) identificado em Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae)pt_BR
dc.title.alternativeMolecular characterization of a Baculovirus (Baculoviridae) Identified in Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae)en
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
unifesp.campusSão Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM)
unifesp.graduateProgramInfectologia
unifesp.knowledgeAreaCiências da saúde
unifesp.researchAreaMedicina
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