Análise das sequências de nucleotídeos de novos subtipos de toxinas e proteínas de anêmonas do mar por sequenciamento de RNA de nova geração

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dc.contributor.advisorKerkis, Irina [UNIFESP]
dc.contributor.advisor-coZaharenko, André Junqueira
dc.contributor.advisor-coLatteshttp://lattes.cnpq.br/3955659940007123
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/4302687618153569
dc.contributor.authorBoralli, Leandro Augusto Freire [UNIFESP]
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/8506788466669898
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)pt_BR
dc.coverage.spatialSão Paulo
dc.date.accessioned2019-06-19T14:57:36Z
dc.date.available2019-06-19T14:57:36Z
dc.date.issued2017-07-31
dc.description.abstractSea anemones are sessile organisms that employ a venomous apparatus (preferably located in their tentacles) to produce and inoculate paralyzing toxins in their prey or to defend themselves. Our group recently contributed to the characterization of the peptidoma of 3 species of sea anemones, showing that the molecular diversity of the toxins of these organisms is much higher than expected. From the point of view of the nucleotide information obtained from anemones, few species were investigated in detail, revealing that at the moment only a small fraction of the toxic arsenal of the cnidarians was investigated. In addition, new structural proteins that occur in anemones present structural and genetic similarity to proteins of derived organisms, such as vertebrates. In this sense, we intend to analyze and compare the transcriptome of two populations of the Brazilian anemone Bunodosoma caissarum, a population of the São Paulo coast and another population located in the isolated São Pedro and São Paulo archipelago. This analysis will be done through the sequencing of new generation RNA, by the Illumina system. With this sequencing and with bioinformatics analyzes we hope to find information regarding new toxins never before studied in this species and also to analyze the differences in the expression profile between the two populationsen
dc.description.abstractAs anêmonas do mar são organismos sésseis que empregam um aparato peçonhento (localizado preferencialmente em seus tentáculos) para produzir e inocular toxinas paralisantes em suas presas ou para defender-se. Nosso grupo contribuiu recentemente na caracterização do peptidoma de 3 espécies de anêmonas do mar, mostrando que a diversidade molecular das toxinas desses organismos é muito maior que o esperado. Do ponto de vista da informação nucleotídica obtida das anêmonas, poucas espécies foram investigadas em detalhe, revelando que no momento apenas uma pequena fração do arsenal tóxico dos cnidários foi investigado. Adicionalmente, novas proteínas estruturais que ocorrem em anêmonas apresentam uma similaridade gênica e estrutural impressionante com proteínas de organismos derivados, tal como vertebrados. Neste sentido, pretendemos analisar e comparar o transcriptoma de duas populações da anêmona brasileira Bunodosoma caissarum, uma população da costa de São Paulo e outra população localizada no arquipélago isolado São Pedro e São Paulo. Essa análise será feita através do sequenciamento de RNA de nova geração, pelo sistema Illumina. Com esse sequenciamento e com análises de bioinformática esperamos encontrar informações referentes a novas toxinas nunca antes estudadas nessa espécie e também analisar as diferenças no perfil de expressão entre as duas populaçõespt_BR
dc.description.sourceDados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2017)
dc.format.extent83 f.
dc.identifierhttps://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5031725pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50217
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectAnemonesen
dc.subjectBunodosomaen
dc.subjectToxinsen
dc.subjectRNA-Seqen
dc.subjectAnemonaspt_BR
dc.subjectBunodosomapt_BR
dc.subjectToxinaspt_BR
dc.subjectRNA-Seqpt_BR
dc.titleAnálise das sequências de nucleotídeos de novos subtipos de toxinas e proteínas de anêmonas do mar por sequenciamento de RNA de nova geraçãopt_BR
dc.title.alternativeAnalysis of nucleotide sequences of new toxin subtypes and proteins of sea anemones by next-generation sequencing of RNAen
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
unifesp.campusEscola Paulista de Medicina (EPM)pt_BR
unifesp.graduateProgramBiologia estrutural e funcionalpt_BR
unifesp.knowledgeAreaBiologia Celular e Molecularpt_BR
unifesp.researchAreaBiologia Estrutural e Funcional Aplicadapt_BR
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Leandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdf
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Dissertação de mestrado
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