Determinação do perfil lipídico metabolômico plasmático, por espectrometria de massas, de pacientes com neoplasias mieloproliferativas crônicas, síndromes mielodisplásicas e leucemia mieloide aguda
Data
2015-03-25
Tipo
Dissertação de mestrado
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Resumo
Introduction: There are thousands of individual lipid species in the cells interacting in different compartments in the cell membrane. The functional consequences of this diversity are not yet fully understood and new technological tools are being developed with the aim of a more comprehensive investigation. Over the past two decades, mass spectrometry (MS) has emerged as the main method used in lipidomics analysis, which allows the structural characterization and quantification of complex lipids and their metabolites. Due to the importance of this field we have considered the use of the lipidomic innovative platform to identify differences in the plasma lipid metabolomic profile of hematological patients with Myeloid Neoplasms. Purpose: Determine the lipid metabolomic profile comparative of blood plasma samples from healthy individuals and patients with Myeloproliferative Neoplasms, Myelodysplastic Syndromes and Acute Myeloid Leukemia and evaluate the existence of possible biomarkers. Methods: Untargeted Shotgun MS/MS Analysis was performed from plasma samples from 153 participants were analyzed being, 90 of the Control Group, 43 Myeloproliferative Neoplasms, 11 Myelodysplastic Syndromes and 9 Acute Myeloid Leukemias. Data were acquired using the AB-Sciex Analyst TF, processed using the AB-Sciex LipidView? and the web-based analytical pipeline MetaboAnalyst 2.0. Results: Untargeted analysis identified in negative and positive-modes a total of 658 features at 2 ppm resolution. PCA and PLS-DA analysis revealed clear discrimination among groups, in particular for AML patients. Main lipid groups differentially expressed were: Monoacylglycerols (MAG), Glucosylceramide E (GlcdE), Ethyl Esters (EE), Lysophosphatidic acid (LPA), Sulfoquinovosil diacylglycerols (SQDG), Monoglycerols (MG), Methyl Ethanolamines (ME), Lysophosphatidylcholines (LPC), Dimethyl Phosfatidyletanilamines (DMPE), Monometylphosphatidiletanolamines (MMPE), Ceramide-1-phosphate (CerP), Glicerophosphoglycerols (GP), Lysomonomethyl-Phosphatidyl ethanolamines (LMMPE), Phosphatidic Acids (PA), Ergosterols (ERG), Glycerophosphoserine (PS), Diacylglycerols (DAG), Hexocylceramides (HexCer) and Lanosterol (Lan). ROC Curve Analysis revealed Total LMMPE as the strongest discriminating marker between Controls from Patients with MDS or AML (Sensitivity= 0.95 (0.824-1); Specificity= 0.8941 (0.847-0953); Positive Likelihood Ratio= 8.972 and Negative Likelihood Ratio =0.05592 and T Test= 7.576E-12). In addition these lipids were also able to differentiate MDS and AML from NMP (Sensitivity= 0.9118 (0.824-1), Specificity= 0.95 (0.85-1); Positive Likelihood Ratio= 18.2 and Negative Likelihood Ratio= 0.05592). Conclusions: The Myeloproliferative Neoplasms from the point of view of global plasma lipidomics are accompanied by several modifications. In particular the Lysomonomethyl-Phosphatidyl ethanolamines seems to play important differentiating roles among them.
Introdução: Milhares de espécies individuais de lipídeos estão presentes nas células, interagindo em diferentes compartimentos e na membrana celular. As consequências funcionais dessa diversidade ainda não são totalmente compreendidas e novas ferramentas tecnológicas estão sendo desenvolvidas com a finalidade de uma investigação mais abrangente. Ao longo das últimas duas décadas, a Espectrometria de Massas (MS) tem emergido como o principal método utilizado em análises lipidômicas, que permite a caracterização estrutural e quantificação de lipídeos complexos e seus metabólitos. Neste trabalho consideramos inovadora a utilização desta plataforma para identificar alterações no perfil lipídico metabolômico plasmático de neoplasias mieloides, assim como temos visto o interesse de pesquisadores de diferentes disciplinas. Objetivo: Determinar o perfil lipídico metabolômico comparativo de amostras de plasma sanguíneo de indivíduos saudáveis e pacientes com Neoplasias Mieloproliferativas, Síndromes Mielodisplásicas e Leucemia Mieloide Aguda; e avaliar a existência de possíveis biomarcadores. Método: A análise não direcionada Shotgun MS / MS foi realizada em amostras de plasma de 153 participantes sendo 90 do grupo controle, 43 Neoplasias Mieloproliferativas Neoplasias, 11 de Síndromes Mielodisplásicas e 9 de Leucemia Mieloide aguda. Os dados foram adquiridos usando o TF Analist AB-Sciex, processados pelo AB-Sciex LipidView? e analisados pelo programa MetaboAnalyst. 2.0. Resultados: A análise não direcionada identificou nos modos negativo e positivo um total de 658 íons em resolução 2 ppm. As análises por PCA e PLS-DA revelaram clara discriminação entre os grupos, em especial para pacientes com LMA. Os principais grupos de lipídeos diferencialmente expressos foram: monoacilglicerois (MAG), glicosilceramida E (GlcdE), ésteres etílicos (EE), ácido Lisofosfatídico (LPA), diacilgliceróis Sulfoquinovosil (SQDG), Monoglicerois (MG), Metil Etanolaminas (ME), Lisofosfatidilcolinas (LPC), Dimetil Fosfatidiletanoilaminas (DMPE), Monometilfosfatidiletanolaminas (MMPE), ceramida-1-fosfato (CERP), Glicerofofoglicerois (GP), Lisomonometil fosfatidil etanolaminas (LMMPE), Ácidos Fosfatídicos (PA), Ergosterois (ERG), Glicerofosfoserina (PS),Diacilgliceróis (DAG), Hexosillceramidas (HexCer) e Lanosterol (Lan). A análise da curva ROC revelou o total LMMPE como o mais forte marcador para discriminar controles de pacientes com SMD ou LMA (Sensibilidade = 0,95 (0,824-1); Especificidade = 0,8941 (0,847-0953); Valor preditivo positivo = 8,972 e Valor preditivo negativo = 0,05592 e Teste T = 7.576E-12). Além disso, esses lipídeos também foram capazes de diferenciar SMD e LMA de NMP (Sensibilidade = 0,9118 (0,824-1), especificidade = 0,95 (0,85-1), Valor preditivo positivo = 18,2 e valor preditivo positivo = 0,05592). Conclusão: As Neoplasias Mieloproliferativas do ponto de vista das análises lipidômicas plasmáticas globais, são acompanhadas por várias modificações. Em particular, o Lisomonometil-fosfatidil etanolaminas parece desempenhar um papel importante de diferenciação entre elas.
Introdução: Milhares de espécies individuais de lipídeos estão presentes nas células, interagindo em diferentes compartimentos e na membrana celular. As consequências funcionais dessa diversidade ainda não são totalmente compreendidas e novas ferramentas tecnológicas estão sendo desenvolvidas com a finalidade de uma investigação mais abrangente. Ao longo das últimas duas décadas, a Espectrometria de Massas (MS) tem emergido como o principal método utilizado em análises lipidômicas, que permite a caracterização estrutural e quantificação de lipídeos complexos e seus metabólitos. Neste trabalho consideramos inovadora a utilização desta plataforma para identificar alterações no perfil lipídico metabolômico plasmático de neoplasias mieloides, assim como temos visto o interesse de pesquisadores de diferentes disciplinas. Objetivo: Determinar o perfil lipídico metabolômico comparativo de amostras de plasma sanguíneo de indivíduos saudáveis e pacientes com Neoplasias Mieloproliferativas, Síndromes Mielodisplásicas e Leucemia Mieloide Aguda; e avaliar a existência de possíveis biomarcadores. Método: A análise não direcionada Shotgun MS / MS foi realizada em amostras de plasma de 153 participantes sendo 90 do grupo controle, 43 Neoplasias Mieloproliferativas Neoplasias, 11 de Síndromes Mielodisplásicas e 9 de Leucemia Mieloide aguda. Os dados foram adquiridos usando o TF Analist AB-Sciex, processados pelo AB-Sciex LipidView? e analisados pelo programa MetaboAnalyst. 2.0. Resultados: A análise não direcionada identificou nos modos negativo e positivo um total de 658 íons em resolução 2 ppm. As análises por PCA e PLS-DA revelaram clara discriminação entre os grupos, em especial para pacientes com LMA. Os principais grupos de lipídeos diferencialmente expressos foram: monoacilglicerois (MAG), glicosilceramida E (GlcdE), ésteres etílicos (EE), ácido Lisofosfatídico (LPA), diacilgliceróis Sulfoquinovosil (SQDG), Monoglicerois (MG), Metil Etanolaminas (ME), Lisofosfatidilcolinas (LPC), Dimetil Fosfatidiletanoilaminas (DMPE), Monometilfosfatidiletanolaminas (MMPE), ceramida-1-fosfato (CERP), Glicerofofoglicerois (GP), Lisomonometil fosfatidil etanolaminas (LMMPE), Ácidos Fosfatídicos (PA), Ergosterois (ERG), Glicerofosfoserina (PS),Diacilgliceróis (DAG), Hexosillceramidas (HexCer) e Lanosterol (Lan). A análise da curva ROC revelou o total LMMPE como o mais forte marcador para discriminar controles de pacientes com SMD ou LMA (Sensibilidade = 0,95 (0,824-1); Especificidade = 0,8941 (0,847-0953); Valor preditivo positivo = 8,972 e Valor preditivo negativo = 0,05592 e Teste T = 7.576E-12). Além disso, esses lipídeos também foram capazes de diferenciar SMD e LMA de NMP (Sensibilidade = 0,9118 (0,824-1), especificidade = 0,95 (0,85-1), Valor preditivo positivo = 18,2 e valor preditivo positivo = 0,05592). Conclusão: As Neoplasias Mieloproliferativas do ponto de vista das análises lipidômicas plasmáticas globais, são acompanhadas por várias modificações. Em particular, o Lisomonometil-fosfatidil etanolaminas parece desempenhar um papel importante de diferenciação entre elas.
Descrição
Citação
OLIVEIRA, Adriana Ramos de. Determinação do perfil lipídico metabolômico plasmático, por espectrometria de massas, de pacientes com neoplasias mieloproliferativas crônicas, síndromes mielodisplásicas e leucemia mieloide aguda. 2015. 71 f. Dissertação (Mestrado) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2015.